home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Celestin Apprentice 4 / Apprentice-Release4.iso / Source Code / Libraries / DCLAP 4j / SeqPups / apps / clustalw.src / testout.msf < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-12-17  |  2.2 KB  |  54 lines  |  [TEXT/R*ch]
  1. PileUp
  2.  
  3.  
  4.  
  5.    MSF:  167  Type: P    Check:  6608   .. 
  6.  
  7.  Name: HBB_HUMAN       oo  Len:  167  Check:   564  Weight:  1.00
  8.  Name: HBB_HORSE       oo  Len:  167  Check:  9621  Weight:  1.00
  9.  Name: HBA_HUMAN       oo  Len:  167  Check:   138  Weight:  1.00
  10.  Name: HBA_HORSE       oo  Len:  167  Check:  1195  Weight:  1.00
  11.  Name: MYG_PHYCA       oo  Len:  167  Check:  5868  Weight:  1.00
  12.  Name: GLB5_PETMA      oo  Len:  167  Check:  9068  Weight:  1.00
  13.  Name: LGB2_LUPLU      oo  Len:  167  Check:   154  Weight:  1.00
  14.  
  15. //
  16.  
  17.  
  18.  
  19. HBB_HUMAN       ........VH LTPEEKSAVT ALWGKVN..V DEVGGEALGR LLVVYPWTQR 
  20. HBB_HORSE       ........VQ LSGEEKAAVL ALWDKVN..E EEVGGEALGR LLVVYPWTQR 
  21. HBA_HUMAN       .........V LSPADKTNVK AAWGKVGAHA GEYGAEALER MFLSFPTTKT 
  22. HBA_HORSE       .........V LSAADKTNVK AAWSKVGGHA GEYGAEALER MFLGFPTTKT 
  23. MYG_PHYCA       .........V LSEGEWQLVL HVWAKVEADV AGHGQDILIR LFKSHPETLE 
  24. GLB5_PETMA      PIVDTGSVAP LSAAEKTKIR SAWAPVYSTY ETSGVDILVK FFTSTPAAQE 
  25. LGB2_LUPLU      ........GA LTESQAALVK SSWEEFNANI PKHTHRFFIL VLEIAPAAKD 
  26.  
  27.  
  28. HBB_HUMAN       FFESFGDLST PDAVMGNPKV KAHGKKVLGA FSDGLAHLD. ....NLKGTF 
  29. HBB_HORSE       FFDSFGDLSN PGAVMGNPKV KAHGKKVLHS FGEGVHHLD. ....NLKGTF 
  30. HBA_HUMAN       YFPHF.DLS. ....HGSAQV KGHGKKVADA LTNAVAHVD. ....DMPNAL 
  31. HBA_HORSE       YFPHF.DLS. ....HGSAQV KAHGKKVGDA LTLAVGHLD. ....DLPGAL 
  32. MYG_PHYCA       KFDRFKHLKT EAEMKASEDL KKHGVTVLTA LGAILKKKG. ....HHEAEL 
  33. GLB5_PETMA      FFPKFKGLTT ADQLKKSADV RWHAERIINA VNDAVASMDD T..EKMSMKL 
  34. LGB2_LUPLU      LFSFLKGTSE VP..QNNPEL QAHAGKVFKL VYEAAIQLQV TGVVVTDATL 
  35.  
  36.  
  37. HBB_HUMAN       ATLSELHCDK LHVDPENFRL LGNVLVCVLA HHFGKEFTPP VQAAYQKVVA 
  38. HBB_HORSE       AALSELHCDK LHVDPENFRL LGNVLVVVLA RHFGKDFTPE LQASYQKVVA 
  39. HBA_HUMAN       SALSDLHAHK LRVDPVNFKL LSHCLLVTLA AHLPAEFTPA VHASLDKFLA 
  40. HBA_HORSE       SNLSDLHAHK LRVDPVNFKL LSHCLLSTLA VHLPNDFTPA VHASLDKFLS 
  41. MYG_PHYCA       KPLAQSHATK HKIPIKYLEF ISEAIIHVLH SRHPGDFGAD AQGAMNKALE 
  42. GLB5_PETMA      RDLSGKHAKS FQVDPQYFKV LAAVIADTVA AG........ .DAGFEKLMS 
  43. LGB2_LUPLU      KNLGSVHVSK GVAD.AHFPV VKEAILKTIK EVVGAKWSEE LNSAWTIAYD 
  44.  
  45.  
  46. HBB_HUMAN       GVANALAHKY H......
  47. HBB_HORSE       GVANALAHKY H......
  48. HBA_HUMAN       SVSTVLTSKY R......
  49. HBA_HORSE       SVSTVLTSKY R......
  50. MYG_PHYCA       LFRKDIAAKY KELGYQG
  51. GLB5_PETMA      MICILLRSAY .......
  52. LGB2_LUPLU      ELAIVIKKEM NDAA...
  53.  
  54.